• Nombre de la compañía : 10x Genomics
  • Área de aplicación: Next Generation Sequencing (NGS)
  • Año de fundación : 2012
  • Ubicación : USA
  • Página web : https://wp.10xgenomics.com/

10x Genomics crea productos para interrogar, comprender y dominar la biología para avanzar en la salud humana.

Sus productos han sido adoptados por investigadores de todo el mundo, incluidas 97 de las 100 principales instituciones de investigación mundiales y 19 de las 20 principales compañías farmacéuticas mundiales, y han sido citados en más de 700 documentos de investigación sobre descubrimientos en las ciencias de la vida, incluida la oncología y la inmunología. y neurociencia.

Single Cell Products

Single Cell Gene Expression

La tecnología de 10x Genomics proporciona una solución exhaustiva y escalable para la caracterización celular y medición de la expresión génica de cientos a miles de células únicas, con alto rendimiento. Esto posibilita el descubrimiento de la dinámica de expresión y el perfil molecular de múltiples tipos de células individuales. Los últimos desarrollos permiten detectar cada vez más transcriptos únicos por célula.

Single Cell Immune Profiling

El análisis de perfil inmunológico de células únicas permite examinar con un enfoque exhaustivo el contexto celular de la respuesta inmune adaptativa y el repertorio inmune de  cientos a millones de linfocitos Ty B. Es una herramienta integral y escalable para el estudio de perfiles de transcripciones V(D)J pareadas de longitud completa.

El flujo de trabajo permite ir desde la preparación de la muestra, la secuenciación y el análisis con un software específico permitiendo descubrimientos en el área de la inmunología, la inmuno-oncología así como en enfermedades infecciosas.

Single Cell CNV

El análisis de CNVs en células únicas proporciona una solución integral y escalable para revelar la heterogeneidad genómica celular y comprender la evolución clonal. Estudiar la patogenia de una enfermedad o caracterizar el mosaicismo neuronal a nivel de una sola célula.

Single Cell ATAC

La aplicación ATAC (Assay for Transposase Accesible Chromatin) permite evaluar la accesibilidad de la cromatina en todo el genoma en cientos a miles de células al mismo tiempo para elucidar los mecanismos regulatorios  de le expresión génica y comprender la heterogeneidad epigenética en alta resolución.

Spatial Products

La relación entre las células y su organización dentro del tejido es crítica para comprender el desarrollo normal y la patología de la enfermedad. La solución de expresión génica espacial Visium mide el ARNm total en secciones de tejido intactas y mapas donde se produce la actividad génica. Esta solución proporciona una vista de alta resolución de la localización de la variabilidad de la expresión génica, ya que se aplica al estudio del cáncer, la neurociencia, la biología del desarrollo y más. La preservación del contexto espacial al identificar distintos grupos de células ofrece información crítica sobre la relación de la función celular, el fenotipo y la ubicación en los microambientes de los tejidos.

Fácilmente adoptable dentro de la infraestructura de laboratorio existente, esta solución permite la visualización resuelta espacialmente de la expresión génica en una amplia variedad de tejidos, sin la necesidad de una preselección objetivo. Utilice nuestro análisis de datos Space Ranger y las herramientas de visualización de Loupe Browser para superponer datos de expresión génica en imágenes H&E. Caracterice el tejido con ARN y la morfología en la misma muestra con flujos de trabajo simples y complementarios para obtener una imagen holística de la biología de una sección de tejido.

  • Combine el análisis de ARNm total resuelto espacialmente con el contexto morfológico
  • Obtenga perfiles de expresión génica de alto rendimiento en una amplia variedad de tipos de muestras
  • Obtenga una visión completa de la complejidad de la enfermedad mediante el mapeo de dónde ocurre toda la actividad genética
  • Descubre nuevos objetivos con análisis imparcial
  • Evite la necesidad de disociar la muestra para realizar estudios de expresión génica

Linked Reads Products

Genome Sequencing – Linked Reads

La tecnología de “Linked Reads” de 10x Genomics permite obtener información de lecturas más largas a partir de la tecnología de secuenciación de lecturas cortas de Illumina®. El análisis de genoma completo con esta tecnología permite facilitar el ensamblaje de las secuencias, resolver mutaciones intra o interalélicas (phasing), revelar variantes estructurales y acceder a regiones del genoma complejas y previamente inaccesibles.

Exome Sequencing – Linked Reads

La tecnología de “Linked Reads” de 10x Genomics permite obtener información de lecturas más largas a partir de la tecnología de secuenciación de lecturas cortas de Illumina®. Esto aplicado al análisis de exoma permite resolver variantes en fase (haplotipos),  variaciones estructurales y detección de número de copias.  Permite discriminar regiones de alta homología de secuencia incluyendo duplicaciones, inversiones y pseudogenes.

Tecnología

El Sistema Chromium funciona con la tecnología Next GEM

Nuestra tecnología patentada Next GEM alimenta nuestro sistema Chromium con un innovador sistema de entrega de reactivos, un conjunto de algoritmos y herramientas de análisis de software llave en mano que permiten el descubrimiento de información genética previamente inaccesible a una velocidad y escala masivas.

La tecnología Next GEM se basa en una nueva arquitectura de chip que se integra a la perfección en las soluciones existentes. Esta tecnología permitirá soluciones futuras y mejoras de productos. La tecnología Next GEM combina nuevos chips y reactivos, y actualmente se ofrece para las siguientes soluciones:

  • Solución de expresión génica de células individuales de cromo – Ver detalles
  • Solución de perfil inmune de células individuales de cromo – Ver detalles
  • Solución ATAC de celda única de cromo – Ver detalles

Visium Technology

La relación entre las células y sus ubicaciones relativas dentro de una muestra de tejido puede ser crítica para comprender la patología de la enfermedad. La transcriptómica espacial es una tecnología innovadora que permite a los científicos medir toda la actividad genética en una muestra de tejido y mapear dónde está ocurriendo la actividad. Esta tecnología ya está conduciendo a nuevos descubrimientos que serán fundamentales para ayudar a los científicos a comprender mejor los procesos biológicos y las enfermedades.

Solución de expresión de genes espaciales Visium

Descubrir más

Para cualquier aplicación que involucre seccionar tejidos, la información morfológica y proteómica es increíblemente importante para resolver la biología. Coloque datos de expresión génica imparciales en sus imágenes y acceda a un nuevo nivel de información. Este complemento a su mancha de interés lo ayudará a comprender los microambientes de tejidos como nunca antes.

Solución llave en mano

La mayoría de las técnicas y muestras de seccionamiento tradicionales son compatibles con tejidos frescos congelados. Siga los protocolos fáciles de seguir de 10x Visium para un flujo de trabajo más corto que lleve su muestra a bibliotecas listas para secuencias.

Herramientas estándar

Para cualquier aplicación que involucre seccionar tejidos, la información morfológica y proteómica es increíblemente importante para resolver la biología. Coloque datos de expresión génica imparciales en sus imágenes y acceda a un nuevo nivel de información. Este complemento a su mancha de interés lo ayudará a comprender los microambientes de tejidos como nunca antes.

Análisis de datos fácil e informativo

Nuestra herramienta Cell Ranger le permite analizar las salidas de datos de Visium en el contexto de la imagen de H&E de tejido. Le brindamos la flexibilidad de cómo analiza sus datos con una interfaz de usuario simple

Instrumentos

Chromium Controller

Esta plataforma representa el corazón de la tecnología de 10x Genomics. Combina de manera rápida y eficiente la partición de un gran número de células, con una diversidad masiva de barcodes para generar > de 100.000 particiones marcadas con barcodes únicos en minutos. Es un sistema compacto de mesada que permite al usuario correr cualquier aplicación desde genoma completo hasta análisis de células únicas.

Chromium Connect

Aumente su productividad en el laboratorio mientras genera resultados de secuenciación de células individuales consistentes y reproducibles con Chromium Connect. Combina la partición de una sola celda, el código de barras y la preparación de la biblioteca en un flujo de trabajo estandarizado y automatizado. El instrumento integra componentes personalizados para el flujo de trabajo 10x Genomics de celda única, reactivos y consumibles específicos de automatización, y una computadora con pantalla táctil fácil de usar.

Vaya más allá del análisis tradicional de expresión génica

La solución de expresión génica de una sola célula de cromo proporciona una solución amplia y escalable para la caracterización celular y el perfil de expresión génica de cientos a decenas de miles de células. Nuestras últimas mejoras le permiten detectar aún más transcripciones únicas por célula, y con la adición de la tecnología de función de códigos de barras, puede obtener una lectura molecular más completa célula por célula: identifique perturbaciones mediadas por CRISPR específicas de la célula o mida simultáneamente el gen y la superficie celular expresión de proteínas en la misma célula, con posibilidades prácticamente ilimitadas para los tipos de características adicionales.

Vaya más allá del análisis tradicional de expresión génica para caracterizar las poblaciones celulares, los tipos celulares, los estados celulares y más, célula por célula. Desde la evaluación de la heterogeneidad tumoral y la composición de células madre, hasta la disección de poblaciones neuronales: los avances tecnológicos proporcionados por la solución de expresión génica de células individuales de cromo, junto con herramientas de software llave en mano, permiten la creación de bibliotecas de alta complejidad a partir de células individuales para maximizar el conocimiento de cualquier tipo de muestra .

  • Identificar y caracterizar tipos de células raras.
  • Analice y comprenda la heterogeneidad celular y cómo esto contribuye a su sistema biológico
  • Realice el fenotipo celular con la secuencia de ARN de una sola célula para identificar nuevos objetivos, biomarcadores y tipos y estados celulares sin la necesidad de objetivos preseleccionados
  • Evaluar los perfiles de expresión de proteínas de la superficie celular y ARNm dentro de la misma célula
  • Realice pantallas genéticas funcionales de alto rendimiento y alta resolución en decenas de miles de células simultáneamente
  • Evaluar fenotipos completos de expresión génica para perturbaciones CRISPR individuales

Perfiles de expresión génica

Descubra la variabilidad de expresión de genes de célula a célula e identifique tipos de células raras en muestras heterogéneas para caracterizar mejor las contribuciones celulares durante el desarrollo y la enfermedad. Nuestras últimas mejoras aumentan enormemente la sensibilidad, por lo que puede detectar aún más transcripciones únicas por celda.

Característica de tecnología de código de barras: proteína de superficie celular

Implemente mejor los métodos publicados como CITE-Seq / REAP-Seq con nuestro nuevo y mejorado flujo de trabajo utilizando la tecnología Feature Barcoding. Mida a la perfección la expresión de proteínas de genes y de superficie celular en la misma célula para identificar isoformas de proteínas, detectar proteínas para transcripciones de baja abundancia y aumentar aún más la especificidad fenotípica.

Tecnología de código de barras de características: Cribado CRISPR

Identifique perturbaciones mediadas por CRISPR junto con transcripciones celulares utilizando la tecnología Feature Barcoding. Implemente esta metodología mejorada y novedosa para realizar pantallas genéticas funcionales escalables y de alto rendimiento en cientos a decenas de miles de células individuales simultáneamente.

Desbloquee el análisis de celda única con estas características del sistema

–  Partición 100 – 80,000+ células eficientemente

–  Sensibilidad superior y tasa de captura de células de hasta 65%

–  Flujo de trabajo simple

–  Flexibilidad de tamaño de celda, sin límites inferiores

–  Tasas de doblete bajas de menos de 0.9% en 1,000 celdas

–  Disponible con tecnología Next GEM

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